Em termos de distribuição geográfica o XI Governo dos Açores terá, para além da Presidência do Governo, sedeada em Ponta Delgada, secretarias em Ponta Delgada, Angra do Heroísmo e na Horta.
Em Ponta Delgada será a sede da Vice-Presidência do Governo, Emprego e Competitividade Empresarial, da Secretaria Regional do Turismo e Transportes e da Subsecretaria Regional da Presidência para as Relações Externas
Em Angra do Heroísmo será a sede da Secretaria Regional da Solidariedade Social, da Secretaria Regional da Saúde e da Secretaria Regional da Educação, Ciência e Cultura.
A Secretaria Regional dos Recursos Naturais ficará sedeada na Horta.