O novo polo do museu, a ser construído no Centro Histórico de Vila do Porto, vai centrar-se na história de Santa Maria iniciada com o povoamento e articular-se-á com a Casa dos Fósseis, centrada no património paleontológico e na história geológica desta ilha, que é a mais antiga dos Açores.

A empreitada enquadra-se nos objetivos do Governo dos Açores de, sob a égide da defesa e valorização do património arquitetónico e cultural regional, prosseguir a redefinição e a consolidação da rede regional de equipamentos culturais, através da sua entrada progressiva em funcionamento e o estabelecimento das necessárias complementaridades, quer através da instalação de novos museus, quer através da requalificação de estruturas existentes.

Com esta Resolução, aprovada no último Conselho do Governo, realizado na ilha do Corvo, o Executivo considera assim concluídos os procedimentos necessários à adjudicação da empreitada, cujo processo se iniciou a 12 de maio de 2015, à proposta considerada mais vantajosa, que foi apresentada pela empresa Marques, S.A.